1. Översiktlig projektbeskrivning

Engelsk titel

Molecular epidemiology and contact tracing in hepatitis B virus infections

Sammanfattning av projektet

Smittspårning vid hepatit B-virus infektion har blivit ett allt vanligare kliniskt önskemål. Med DNA-sekvensering kan virusets arvsmassa fastställas på individnivå. Prover från två eller flera individer kan jämföras för att avgöra om smittosamband föreligger eller har en gemensam källa, vid t ex utbrott. Det finns dock osäkerhet om hur dessa analyser skall utföras och tolkas. Felaktiga resultat kan leda till missvisande information om spridningen och smittvägar, vilket kan bli ödesdigert för individen.

För hepatit B-virus (HBV) har tidigare främst S-regionen, en del av virusets arvsmassa, använts för typning. Även om detta område medger genotypning och subgenotypning är den genetiska variationen där ganska liten. Det är osäkert om området är tillräckligt för att säkert identifiera smittspridning om virusstammarna som cirkulerar uppvisar liten variation. Det gäller särskilt bland missbrukare, där man vet att merparten smittas av en eller några få subtyper. För att bättre bedöma möjligheten till smittspårning av dessa virusstammar behövs ökad kunskap om den genetiska variationen bland de virusstammar som cirkulerar i samhället.

I det här projektet avser vi att utföra DNA-sekvensering av olika regioner i virusgenomet och undersöka den genetiska variationen i HBV hos injektionsmissbrukare i Göteborgsområdet från tre tidsperioder i intervallet 1975-2008. Virusstammarna kommer att jämföras inbördes och med sekvenser av samma subtyp (men från andra orter, i Sverige och Europa, vilka hämtats från GenBank). Slutsatserna förväntas ge viktigt underlag för utförande och tolkning vid molekylärepidemiologisk smittspårning av HBV i framtiden.

Typ av projekt

Kvalitetssäkringsarbete

MeSH-termer för att beskriva ämnesområdet

Inlagda MeSH-termer

Hepatitis B virus

The type species of the genus ORTHOHEPADNAVIRUS which causes human HEPATITIS B and is also apparently a causal agent in human HEPATOCELLULAR CARCINOMA. The Dane particle is an intact hepatitis virion, named after its discoverer. Non-infectious spherical and tubular particles are also seen in the serum.

Contact Tracing

Identification of those persons (or animals) who have had such an association with an infected person, animal, or contaminated environment as to have had the opportunity to acquire the infection. Contact tracing is a generally accepted method for the control of sexually transmitted diseases.

Epidemiology

Field of medicine concerned with the determination of causes, incidence, and characteristic behavior of disease outbreaks affecting human populations. It includes the interrelationships of host, agent, and environment as related to the distribution and control of disease.

Phylogeny

The relationships of groups of organisms as reflected by their genetic makeup.

Projektets delaktighet i utbildning

Avhandling
D-uppsats / Magisterexamen
C-uppsats / Kandidatexamen
ST-läkarutbildning
Annan utbildning
Ej del i utbildning

3. Processen och projektets redovisning

Pågående aktiviteter

Planering och förberedelse före datainsamling
Datainsamling pågår
Analys av insamlade data pågår
Författande av skriftlig redovisning / publikation pågår
En eller flera publikationer från projektet är publicerade
Slutfört och inget mer görs inom ramen för detta projekt

Projektstart (när planeringen påbörjas och börjar dokumenteras skriftligt)

2009-01-01

Datum för påbörjande av datainsamling

2009-05-01