1. Översiktlig projektbeskrivning

Engelsk titel

Molecular epidemiological studies of the microflora and its effects in the stomach and duodenum before and after eradication of Helicobacter pylori

Sammanfattning av projektet

Helicobacter pylori infektion är bakomliggande orsak till kronisk magkatarr (gastrit) samt de flesta fall av magsår (ulcus) och tumör i magsäcken. Risken för tumör är ffa knuten till svår gastrit med körtelförtvining (atrofisk gastrit). Sistnämnda leder även till förhöjda blodnivåer av nedbrytningsprodukten homocystein vilka är associerade till hjärt-kärl sjukdom. Vi har kartlagt prevalens (aktuell förekomst) och incidens (nyinsjuknandefrekvens) av H.pylori infektion och kronisk gastrit samt dess följdsjukdomar i befolkningen. Alla H.pylori infekterade studiedeltagare behandlades och genomgick upprepad screening 2 år senare.

Vi har visat att magsäcken kan innehålla andra bakterier än H.pylori. Vid utveckling av svår atrofisk gastrit försvinner ofta H.pylori och ersätts av en bakteriell blandflora. Det är inte känt vilken roll andra bakterier med eller utan närvaro av H.pylori spelar vid progress av kronisk gastrit samt utveckling av ulcus eller tumör. Likaledes vet man relativt lite om hur behandling mot H.pylori påverkar bakterieflorans profil och resistensmönster (motståndskraft mot antibiotika). Det är känt att andelen antibiotikaresistenta H.pylori stammar ökar med risk för spridning av resistens till andra bakterier.
Såväl graden av inflammation som slemhinnans genomsläpplighet (barriärfunktion) är åtminstone delvis genetiskt betingade. Små variationer (single nucleotide polymorphisms, SNP) i de relevanta generna (cytokiner och tight junction proteiner (TJ) / "tätningsfogar" mellan celler) anses kunna förklara den variation i svar på infektion/inflammation som ses i befolkningen. Ett förhöjt läckage skulle kunna öka immunsystemets exponering för inflammatoriska ämnen.

I det aktuella projektet kommer biologiskt material insamlat före och efter behandling av H.pylori infektion att utgöra basen för molekylärepidemiologiska och patofysiologiska studier av bakteriefloran i magsäck och tolvfingertarm (duodenum). Bakteriefloran, inklusive H.pylori, i biopsimaterial från magsäck och tolvfingertarm kommer att karaktäriseras (inkl. resistensmönster) med molekylärbiologiska metoder. Resultaten sätts i relation till grad och typ av kronisk gastrit/duodenit samt förekomst av ulcussjukdom. Effekter av bakteriefloran på slemhinnan utvärderas genom analys av uttryck av utvalda cytokiner (RNA, protein) i färska biopsier. Graden av generell slemhinneskada vid olika typer av bakterieflora kommer att fastställas genom mätning av slemhinnans barriärfunktion i biopsimaterial (Ussing kammare).
DNA kommer att analyseras för polymorfier i generna för utvalda cytokiner samt TJ proteiner, vars betydelse ej tidigare undersökts.

Vi förväntar oss kunna visa vilka konsekvenser, positiva som negativa, behandling mot H.pylori leder till ur ett befolkningsperspektiv. Betydelsen av närvaron av andra bakterier i magsäck och tolvfingertarm kommer att fastställas. Studierna kommer att utvärdera betydelsen av genetiska variationer hos bakterie och värd vad gäller bakteriell kolonisation och dess konsekvenser.
Genom projektet kommer nya molekylär-epidemiologiska typningsmetoder lämpliga för kliniskt bruk att kunna etableras.

Typ av projekt

Forskningsprojekt

MeSH-termer för att beskriva ämnesområdet

Inlagda MeSH-termer

Digestive System Diseases

Diseases in any part of the GASTROINTESTINAL TRACT or the accessory organs (LIVER; BILIARY TRACT; PANCREAS).

Bacterial Infections and Mycoses

Infections caused by bacteria and fungi, general, specified, or unspecified.

Projektets delaktighet i utbildning

Avhandling
D-uppsats / Magisterexamen
C-uppsats / Kandidatexamen
ST-läkarutbildning
Annan utbildning
Ej del i utbildning

3. Processen och projektets redovisning

Pågående aktiviteter

Planering och förberedelse före datainsamling
Datainsamling pågår
Analys av insamlade data pågår
Författande av skriftlig redovisning / publikation pågår
En eller flera publikationer från projektet är publicerade
Slutfört och inget mer görs inom ramen för detta projekt

Projektstart (när planeringen påbörjas och börjar dokumenteras skriftligt)

2007-01-01

Datum för påbörjande av datainsamling

2008-01-01

Datum då projektet är slutrapporterat

2011-12-31

Publikationer från detta projekt

1. Homocysteine levels in chronic gastritis and other conditions: relations to incident cardiovascular disease and dementia.

   Redéen Stefan, Ryberg Anna, Petersson Fredrik, Eriksson Olle, Nägga Katarina, Borch Kurt.

   Dig Dis Sci. 2010:55(2):351-8.

   [Links: PMID: 19267198 | DOI länk][Source: PubMed®]
2. Characterization of the gastric cardia in volunteers from the general population. Type of mucosa, Helicobacter pylori infection, inflammation, mucosal proliferative activity, p53 and p21 expression, and relations to gastritis.

   Petersson Fredrik, Franzén Lennart E, Borch Kurt.

   Dig Dis Sci. 2010:55(1):46-53.

   [Links: PMID: 19165597 | DOI länk][Source: PubMed®]
3. A Morphometric Study of Antral G-Cell Density in a Sample of Adult General Population: Comparison of Three Different Methods and Correlation with Patient Demography, Helicobacter pylori Infection, Histomorphology and Circulating Gastrin Levels.

   Petersson Fredrik, Borch Kurt, Rehfeld Jens F, Franzén Lennart E.

   International journal of clinical and experimental pathology 2009:2(3):239-48.

   [Links: PMID: 19079618][Source: PubMed®]
4. Concurrent genotyping of Helicobacter pylori virulence genes and human cytokine SNP sites using whole genome amplified DNA derived from minute amounts of gastric biopsy specimen DNA.

   Ryberg Anna, Borch Kurt, Sun Yi-Qian, Monstein Hans-Jürg.

   BMC Microbiol. 2008:8:175.

   [Links: PMID: 18842150 | DOI länk][Source: PubMed®]
5. Multiple strand displacement amplification of DNA isolated from human archival plasma/serum: identification of cytokine polymorphism by pyrosequencing analysis.

   Sun Yi-Qian, Monstein Hans-Jürg, Ryberg Anna, Borch Kurt.

   Clin Chim Acta 2007:377(1):108-13.

   [Links: PMID: 17027952 | DOI länk][Source: PubMed®]

Tillämpning av resultat - tidsaspekt (projektledarens bedömning)

Resultaten kommer sannolikt att tillämpas inom 5 år från projektslut.

Tillämpning av resultat - genomslag (projektledarens bedömning)

Internationellt (i flera länder)