1. Översiktlig projektbeskrivning

Sammanfattning av projektet

Virulens:
De virulensfaktorer hos EHEC som möjligen kan skilja patogena från mindre patogena är okända. Projektet avser att kartlägga eventuella skillnader i förekomst av virulensgener hos EHEC, isolerade från sjuka människor respektive nötkreatur som är den huvudsakliga smittkällan. Särskilt kommer gener som är av betydelse för bakteriens förmåga att binda till värdens tarmepitelceller samt att tillgodogöra sig Fe3+ att studeras.
E. coli liksom alla levande celler kräver järn för sin tillväxt och delning och bakterier som har effektivast system för att komma åt järn förväntas ha en tillväxtfördel i värdens tarmflora. Den vanligaste smittkällan till human EHEC infektion är opastöriserad mjölk och kött från nötkreatur, samt fördoämnen tex sallad som producerats på gårdar i nära anslutning till nötkreatur. Upp till 80% av svenska nötkreatur är bärare av EHEC men sannolikt är inte alla humanpatogena i samma utsträckning. Det skulle vara av mycket stort samhällsekonomiskt och etiskt värde att veta vilka djurs EHEC som kan orsaka human infektion och undanröja dessa.

Typning:
Projektet avser också utveckla typningen av EHEC både de av serogrupp O157 och icke O157. Epidemiologisk typning av EHEC är av avgörande betydelse vid smittutredningar och smittspårning. Trots ökad kunskap om smittkällor och smittvägar finns fortfarande stora kunskapsluckor när det gäller frågan om var smittan kommer ifrån och hur den sprids. Försök har inletts att typa EHEC genom PCR av locus med varierande antal repetitioner sk tandem repeats (TR). Även om metoden behöver justeras något,fler locus behöver analyseras, ser den ut att fungera väl. Emellertid kan denna metoden bara användas för EHEC O157. Vi ämnar nu inleda försök att typa EHEC genom sekvensering av ett eller flera locus som innehåller TR. Eftersom en sådan metod är på väg att slå igenom vad gäller methicillin resistena S. aureus ser vi det som sannolikt att metoden ska vara användbar även när det gäller EHEC oavsett serogrupp.

Typ av projekt

Forskningsprojekt

MeSH-termer för att beskriva ämnesområdet

Inlagda MeSH-termer

Escherichia

A genus of gram-negative, facultatively anaerobic, rod-shaped bacteria whose organisms occur in the lower part of the intestine of warm-blooded animals. The species are either nonpathogenic or opportunistic pathogens.

Escherichia coli Proteins

Proteins obtained from ESCHERICHIA COLI.

Escherichia coli K12

A species of gram-negative, rod-shaped bacteria belonging to the K serogroup of ESCHERICHIA COLI. It lives as a harmless inhabitant of the human LARGE INTESTINE and is widely used in medical and GENETIC RESEARCH.

Escherichia coli O157

A verocytotoxin-producing serogroup belonging to the O subfamily of Escherichia coli which has been shown to cause severe food-borne disease. A strain from this serogroup, serotype H7, which produces SHIGA TOXINS, has been linked to human disease outbreaks resulting from contamination of foods by E. coli O157 from bovine origin.

Projektets delaktighet i utbildning

Avhandling
D-uppsats / Magisterexamen
C-uppsats / Kandidatexamen
ST-läkarutbildning
Annan utbildning
Ej del i utbildning

3. Processen och projektets redovisning

Pågående aktiviteter

Planering och förberedelse före datainsamling
Datainsamling pågår
Analys av insamlade data pågår
Författande av skriftlig redovisning / publikation pågår
En eller flera publikationer från projektet är publicerade
Slutfört och inget mer görs inom ramen för detta projekt

Projektstart (när planeringen påbörjas och börjar dokumenteras skriftligt)

2007-01-01

Datum för påbörjande av datainsamling

2008-01-01

Tillämpning av resultat - tidsaspekt (projektledarens bedömning)

Resultaten kommer sannolikt att tillämpas inom 1 år från projektslut.

Tillämpning av resultat - genomslag (projektledarens bedömning)

Nationellt (i stor del av landet)