1. Översiktlig projektbeskrivning

Sammanfattning av projektet

Infektioner i centrala nervsystemet (CNS) som yttrar sig som meningiter och encefaliter är potentiellt livshotande tillstånd. Dessa kräver snabb diagnostik, handläggning och insättande av korrekt och riktad behandling. Det har skett en massiv forskningsutveckling inom diagnostiken på senare tid. Nya behandlingsmöjligheter och –rekommendationer har framtagits, framförallt vad beträffar virusorsakade CNS infektioner. Även ”facit ” för bakteriella CNS infektioner har förändrats med molekylär diagnostik som kan påvisa svårodlade bakterier (tex mykobakterier, mykoplasma och chlamydia). Många av patienterna är idag äldre. Större grupper är immunsupprimerade, vilket innebär att de inte alltid uppvisar den typiska kliniska bilden vid en bakteriell meningit samt att de har benägenhet att reaktivera latenta virusinfektioner. Ett stort genombrott är att molekylär detektion av bakterier numera kan utföras. För att nå hög känslighet i kliniska prover kommer total-genoms-amplifiering att prövas. Det är en metod som amplifierar allt DNA i provet före specifik PCR-amplifiering av 16S rDNA. Metoden har visats vara framgångsrik för att påvisa mycket små mängder bakterier i t.ex. biopsimaterial där mer konventionell odlingsteknik ej har fungerat. Den virala artbestämningen måste ske med specifika PCR-metoder för varje virus, då motsvarande virusspecifika sekvenser saknas jämfört med 16S rDNA för bakterier. Tidigare epidemiologiska studier som publicerats baserade på molekylära metoder har sällan undersökt förekomsten av både virus och bakterier. Andelen okända agens i undersökta material har visat sig variera mellan 17-50% i publicerade studier. Syftet med denna studie är att få en uppdaterad epidemiologisk bild av vilka agens som finns inom vårt geografiska område (som de fästingöverförda sjukdomarna Borrelia och TBE) samt vilka kliniska symptom som är kopplade till respektive agens. Studien avser att inkludera alla patienter i sydöstra sjukvårdsregionen där lumbalpunktion är indicerat på misstanke om CNS-infektion . Akut rutindiagnostik utförs enligt gängse rutiner på varje mikrobiologiskt laboratorium i regionen. Förutom det, kommer ett likvorrör (250 ul) samt ett serumrör att skickas till Linköpings mikrobiologiska laboratorium för utökad diagnostik i enlighet med denna studie. Alla diagnostiska resultat analyseras och sätts i relation till remissuppgifter om patientens symptom och insjukningstid. Studien beräknas löpa under ca 4 år. Resultaten av studien är viktiga för att kunna uppdatera vårdprogram för patienter med CNS-infektioner där diagnostiken tidigare varit begränsande. Med ökade kunskaper, genom denna studie, kan vi sträva mot effektivare handläggning vilken minskar patienternas lidande och deras risk för bestående resttillstånd. Den nya kunskapen kan medföra en rationell användning av antibakteriella- och/eller antivirala läkemedel. Dessutom kan en optimalare handläggning innebära kortare vårdtider.

Typ av projekt

Forskningsprojekt

MeSH-termer för att beskriva ämnesområdet

Inlagda MeSH-termer

Central Nervous System Infections

Pathogenic infections of the brain, spinal cord, and meninges. DNA VIRUS INFECTIONS; RNA VIRUS INFECTIONS; BACTERIAL INFECTIONS; MYCOPLASMA INFECTIONS; SPIROCHAETALES INFECTIONS; fungal infections; PROTOZOAN INFECTIONS; HELMINTHIASIS; and PRION DISEASES may involve the central nervous system as a primary or secondary process.

Central Nervous System Diseases

Diseases of any component of the brain (including the cerebral hemispheres, diencephalon, brain stem, and cerebellum) or the spinal cord.

Nervous System Diseases

Diseases of the central and peripheral nervous system. This includes disorders of the brain, spinal cord, cranial nerves, peripheral nerves, nerve roots, autonomic nervous system, neuromuscular junction, and muscle.

Meningitis

Inflammation of the coverings of the brain and/or spinal cord, which consist of the PIA MATER; ARACHNOID; and DURA MATER. Infections (viral, bacterial, and fungal) are the most common causes of this condition, but subarachnoid hemorrhage (HEMORRHAGES, SUBARACHNOID), chemical irritation (chemical MENINGITIS), granulomatous conditions, neoplastic conditions (e.g., carcinomatous meningitis), and other inflammatory conditions may produce this syndrome. (From Joynt, Clinical Neurology, 1994, Ch24, p6)

Meningitis, Viral

Viral infections of the leptomeninges and subarachnoid space. TOGAVIRIDAE INFECTIONS; FLAVIVIRIDAE INFECTIONS; RUBELLA; BUNYAVIRIDAE INFECTIONS; ORBIVIRUS infections; PICORNAVIRIDAE INFECTIONS; ORTHOMYXOVIRIDAE INFECTIONS; RHABDOVIRIDAE INFECTIONS; ARENAVIRIDAE INFECTIONS; HERPESVIRIDAE INFECTIONS; ADENOVIRIDAE INFECTIONS; JC VIRUS infections; and RETROVIRIDAE INFECTIONS may cause this form of meningitis. Clinical manifestations include fever, headache, neck pain, vomiting, PHOTOPHOBIA, and signs of meningeal irritation. (From Joynt, Clinical Neurology, 1996, Ch26, pp1-3)

RNA Virus Infections

Arenaviridae Infections

Virus diseases caused by the ARENAVIRIDAE.

Central Nervous System Viral Diseases

Viral infections of the brain, spinal cord, meninges, or perimeningeal spaces.

Virus Diseases

A general term for diseases produced by viruses.

Borrelia

A genus of gram-negative, anaerobic, helical bacteria, various species of which produce RELAPSING FEVER in humans and other animals.

Borrelia Infections

Infections with bacteria of the genus BORRELIA.

Encephalitis, Tick-Borne

Encephalitis caused by neurotropic viruses that are transmitted via the bite of TICKS. In Europe, the diseases are caused by ENCEPHALITIS VIRUSES, TICK-BORNE, which give rise to Russian spring-summer encephalitis, central European encephalitis, louping ill encephalitis, and related disorders. Powassan encephalitis occurs in North America and Russia and is caused by the Powassan virus. ASEPTIC MENINGITIS and rarely encephalitis may complicate COLORADO TICK FEVER which is endemic to mountainous regions of the western United States. (From Joynt, Clinical Neurology, 1996, Ch26, pp14-5)

Encephalitis Viruses, Tick-Borne

A subgroup of the genus FLAVIVIRUS that causes encephalitis and hemorrhagic fevers and is found in eastern and western Europe and the former Soviet Union. It is transmitted by TICKS and there is an associated milk-borne transmission from viremic cattle, goats, and sheep.

Tick-Borne Diseases

Bacterial, viral, or parasitic diseases transmitted to humans and animals by the bite of infected ticks. The families Ixodidae and Argasidae contain many bloodsucking species that are important pests of man and domestic birds and mammals and probably exceed all other arthropods in the number and variety of disease agents they transmit. Many of the tick-borne diseases are zoonotic.

Projektets delaktighet i utbildning

Avhandling
D-uppsats / Magisterexamen
C-uppsats / Kandidatexamen
ST-läkarutbildning
Annan utbildning
Ej del i utbildning

3. Processen och projektets redovisning

Pågående aktiviteter

Planering och förberedelse före datainsamling
Datainsamling pågår
Analys av insamlade data pågår
Författande av skriftlig redovisning / publikation pågår
En eller flera publikationer från projektet är publicerade
Slutfört och inget mer görs inom ramen för detta projekt

Projektstart (när planeringen påbörjas och börjar dokumenteras skriftligt)

2009-01-15

Datum för påbörjande av datainsamling

2009-06-30

Publikationer från detta projekt

1. Real-time PCR detection of Human Herpesvirus 1-5 in patients lacking clinical signs of a viral CNS infection.
   Sundén Birgitta, Larsson Marie, Falkeborn Tina, Paues Jakob, Forsum Urban, Lindh Magnus, Ydrenius Liselotte, Akerlind Britt, Serrander Lena.
   BMC Infect Dis. 2011:11:220.[Source: PubMed®]
   [Links: PMID: 21849074 | DOI länk]

Tillämpning av resultat - tidsaspekt (projektledarens bedömning)

Resultaten tillämpas redan i praktisk verksamhet.

Tillämpning av resultat - genomslag (projektledarens bedömning)

Nationellt (i stor del av landet)

Tillämpning av resultat - beskrivning

Den första delen av projektet är klar. Metoder för detektion av virala agens är uppsatta, samt 16S PCR med sekvensering. Dessa metoder är införda i kliniskt bruk. Ett manskript har publicerats som består av en studie där vi studerat om herpesgruppens virus kan finnas som mormalflora i cerebrospinalvätska. Resultaten från studien talar för att de inte detekteras i CSV utan typiska symptom, dvs inte förekommer som normalflora förutom att man kan detektera EBV utan säker klinisk signifikans.