1. Översiktlig projektbeskrivning

Engelsk titel

Development of faster blood culture diagnostics and evaluation of the value for patients with bacteraemia after implementation of this methodology.

Sammanfattning av projektet

Sepsis karaktäriseras av bakterier i blodbanan samt 2 av följande symptom; feber, ökad andningsfrekvens, takykardi och en ökning av leukocyter i blodbanan. Snabb handläggning och tidigt given, adekvat antibiotikabehandling är essentiellt för att minska morbiditet samt mortalitet. Förekomsten av allvarliga septikemier med multiresistenta bakterier som meticillinresistenta staphylokocker (MRSA) och gramnegativa bakterier med extended spectrum betalaktmases (ESBL) är i ökande både i Sverige och omvärlden och ställer krav på en snabb och säker diagnostik.
Det är inte möjligt att vänta med antibiotikabehandling i avvaktan på mikrobiell diagnostik, som ofta tar 24-48 timmar från provtagning till komplett svar, vilket medför att patienterna ofta erhåller bredspektrumantibiotika fram till att den mikrobiella diagnostiken är klar. Då resistensutvecklingen är betydande, särskilt i sjukhusmiljön, är det viktigt att förkorta den sk empiriska bredpektrumantibiotikabehandlingen till högst 1-3 dygn. Det förekommer också att man i fall av mer ovanliga bakterier inte har tillräcklig täckning med bredspektrumantibiotika, särskilt i fall av multiresistens och dessa är särskilt viktiga att identifiera mikrobiologiskt tidigt i förloppet.
Syftet med studien är att undersöka hur den mikrobiella blododlingsdiagnostiken kan bli snabbare för att så smal och riktad antibiotikabehandling ska kunna ges så snabbt som möjligt samt att snabbt kunna identifiera multiresistenta bakterier som MRSA och ESBL vilka är kopplade till en betydande mortalitet.
Preliminära data visar att man genom enkla tester, PCR-metodik och förändrat logistikflöde på lab kan korta tiderna till utsvar minst 1 dygn. Med denna metod kan man också signalera tidigt om det är en multresistent bakterie, tex MRSA med PCR-baserad metodik direkt från larmad blodflaska. Vidare kan automatiserade system ge snabbare art och resistensbestämning vid sepsis orsakade av gramnegativa stavar inklusive ESBL. Tidigare studier har även visat att sekvensering av en generell bakteriell gen, 16S rDNA, kan vara av värde, i synnerhet vid infektioner med svårodlade bakterier där diagnostiken idag är långsam vilket lätt fördröjer insättning av korrekt behandling. Vi kommer att upprätta ett diagnostikpaket med ny PCR-baserad metodik och logistiska lösningar för snabbare blododlingssvar. Därefter kommer konsekutiva blodisolat analyseras med denna metodik och uppföljning av snabbhet i ev byte av antibiotikabehandling hos patienterna att utvärderas.

Typ av projekt

Forskningsprojekt

MeSH-termer för att beskriva ämnesområdet

Inlagda MeSH-termer

Sepsis

Systemic inflammatory response syndrome with a proven or suspected infectious etiology. When sepsis is associated with organ dysfunction distant from the site of infection, it is called severe sepsis. When sepsis is accompanied by HYPOTENSION despite adequate fluid infusion, it is called SEPTIC SHOCK.

Infection

Invasion of the host organism by microorganisms that can cause pathological conditions or diseases.

Systemic Inflammatory Response Syndrome

A systemic inflammatory response to a variety of clinical insults, characterized by two or more of the following conditions: (1) fever >38 degrees C or HYPOTHERMIA <36 degrees C; (2) TACHYCARDIA >90 beat/minute; (3) tachypnea >24 breaths/minute; (4) LEUKOCYTOSIS >12,000 cells/cubic mm or 10% immature forms. While usually related to infection, SIRS can also be associated with noninfectious insults such as TRAUMA; BURNS; or PANCREATITIS. If infection is involved, a patient with SIRS is said to have SEPSIS.

Diagnosis

The determination of the nature of a disease or condition, or the distinguishing of one disease or condition from another. Assessment may be made through physical examination, laboratory tests, or the likes. Computerized programs may be used to enhance the decision-making process.

Projektets delaktighet i utbildning

Avhandling
D-uppsats / Magisterexamen
C-uppsats / Kandidatexamen
ST-läkarutbildning
Annan utbildning
Ej del i utbildning

2. Projektorganisation och finansiering

Ekonomiska stöd till projektet

3. Processen och projektets redovisning

Pågående aktiviteter

Planering och förberedelse före datainsamling
Datainsamling pågår
Analys av insamlade data pågår
Författande av skriftlig redovisning / publikation pågår
En eller flera publikationer från projektet är publicerade
Slutfört och inget mer görs inom ramen för detta projekt

Projektstart (när planeringen påbörjas och börjar dokumenteras skriftligt)

2009-01-15

Datum för påbörjande av datainsamling

2009-03-01

Tillämpning av resultat - tidsaspekt (projektledarens bedömning)

Resultaten tillämpas redan i praktisk verksamhet.

Tillämpning av resultat - genomslag (projektledarens bedömning)

Internationellt (i flera länder)

Tillämpning av resultat - beskrivning

Metodutvecklingen med snabbare rapportering av blododlingssvar har kunnat appliceras i Kalmar sedan mars 2009 och har implementerats delvis i Linköping. Två manuskript om metodikutvecklingsdelen planeras skickas till refereegranskad tidskrift inom kort.