1. Översiktlig projektbeskrivning

Engelsk titel

Norovirus infection - mortality, clinical characteristics, epidemiology and viral evolution

Sammanfattning av projektet

Noro- och sapovirus utgör tillsammans gruppen humana calicivirus. Calicivirusenterit, eller "vinterkräksjuka", är orsaken till mer än 90% av alla gastroenteriter som inte orsakas av bakterier, i västvärlden. Smitta och sjukdom medför ett ofta uttalat lidande som hos äldre och hos patienter med kroniska sjukdomar i stor utsträckning gör inneliggande vård nödvändig för den drabbade. Särskilt norovirus är mycket smittsamt, och epidemier av norovirusenterit (NVE) på sjukhus och vårdinrättningar är vanliga och orsakar betydande störningar i tillgången på såväl akut som planerad sjukvård. Omfattningen av direkt och indirekt överdödlighet i NVE är ofullständigt kartlagd.
Cirkulerande stammar av norovirus genomgår en ständig genetisk förändring, "antigen drift", vilket ger förutsättningar för nya utbrott varje säsong. Nyligen publicerade studier har påvisat långvarigt bärarskap hos såväl immunsupprimerade som immunfriska individer. Betydelsen av detta bärarskap är okänd men en snabb genetisk förändring hos viruset har påvisats hos immunfriska bärare.
Projektet avser att i tre steg studera sjukdomsbördan, dödlighet och spridningsmönster för NVE vid Sahlgrenska Universitetssjukhuset (SU) under två vintersäsonger. Steg I är en retrospektiv genomgång av alla patienter med NVE inlagda på SU under säsongen 2008-2009. Steg II är en prospektiv studie av de som vårdas med NVE på Infektionskliniken, SU/Östra 2010-2011. Steg III är en prospektiv studie av patienter som söker med gastroenteritsymtom på Akutmottagningen, SU/Östra. Arbetet med steg I är avklarat och manuskript är inskickat för publicering. Arbetet med steg II och III pågår.

Epidemiologiska, kliniska, vårdhygieniska och virologiska samband kommer att studeras. Förhoppningen är att kunna erhålla ökad kunskap om problemet och dess omfattning för att därigenom kunna identifiera lämpliga angreppspunkter i det fortsatta arbetet med att förbättra diagnostik och omhändertagande samt bedömning av lämplig vårdnivå och isoleringsbehov för patienter med NVE.

Den primära frågeställningen i projektet är huruvida norovirus orsakar en överdödlighet hos vissa typer av patienter. Som ett led i detta kommer kliniska och laboratoriemässiga parametrar och deras samband med dödligheten att studeras. Vi kommer även att undersöka hur många som fortsätter bära på viruset i tarmen en längre tid efter att de varit sjuka (så kallade långtidsbärare), och vilken betydelse dessa personer har för virusets utveckling och spridning.

I den första delen av projektet har vi studerat patienter som drabbades av NVE under säsongen 2008-2009 genom att studera deras journaler. I den andra delen undersöks patienter som vårdas på Infektionskliniken, SU/Östra under 2010 och 2011 på grund av NVE genom att provta de deltagande personerna för virus vid flera tidpunkter under och efter vårdtiden, samt mäta fysikaliska mätvärden (exempelvis blodtryck) och vissa laboratorieprover. På liknande sätt undersöks de patienter som deltar i del III av studien på Akutmottagningen, SU/Östra men provtagningen sker där endast vid ett tillfälle. Uppgifter om avlidna patienter och dödsdatum fås via det patientadministrativa systemet (ELVIS). Vi planerar också att kartlägga hur virus som påvisas hos samma person vid olika tillfällen förändras över tiden med hjälp av så kallad sekvensering. Vi kommer också att ta fram ett kontrollmaterial med patienter som inte har insjuknat med NVE som används för jämförelser med patienterna i studien avseende de saker vi har valt att undersöka, till exempel dödlighet.

Med hjälp av våra resultat hoppas vi kunna ge en bättre bild av hur norovirus kan spridas på och utanför sjukhus och vilka faktorer som påverkar denna spridning, samt slå fast hur stor påverkan NVE har på den som drabbas i form av ökad sjuklighet eller dödlighet och vilka faktorer hos viruset och den drabbade som har betydelse för denna sjuklighet och dödlighet.

Typ av projekt

Forskningsprojekt

MeSH-termer för att beskriva ämnesområdet

Inlagda MeSH-termer

Caliciviridae Infections

Virus diseases caused by CALICIVIRIDAE. They include HEPATITIS E; VESICULAR EXANTHEMA OF SWINE; acute respiratory infections in felines, rabbit hemorrhagic disease, and some cases of gastroenteritis in humans.

Norwalk virus

The type species in the genus NOROVIRUS, first isolated in 1968 from the stools of school children in Norwalk, Ohio, who were suffering from GASTROENTERITIS. The virions are non-enveloped spherical particles containing a single protein. Multiple strains are named after the places where outbreaks have occurred.

Virology

Evolution, Molecular

Evolution at the molecular level of DNA sequences and proteins. (Rieger et al., Glossary of Genetics: Classical and Molecular, 5th ed)

Projektets delaktighet i utbildning

Avhandling
D-uppsats / Magisterexamen
C-uppsats / Kandidatexamen
ST-läkarutbildning
Annan utbildning
Ej del i utbildning

2. Projektorganisation och finansiering

Ekonomiska stöd till projektet

3. Processen och projektets redovisning

Pågående aktiviteter

Planering och förberedelse före datainsamling
Datainsamling pågår
Analys av insamlade data pågår
Författande av skriftlig redovisning / publikation pågår
En eller flera publikationer från projektet är publicerade
Slutfört och inget mer görs inom ramen för detta projekt

Projektstart (när planeringen påbörjas och börjar dokumenteras skriftligt)

2010-01-28

Datum för påbörjande av datainsamling

2010-10-31

Tillämpning av resultat - tidsaspekt (projektledarens bedömning)

Resultaten kommer sannolikt att tillämpas inom 5 år från projektslut.

Tillämpning av resultat - genomslag (projektledarens bedömning)

Hos samma huvudman utanför projektledarens arbetsplats